有關自來水加氟預防齲齒問題，按國內外有關資料及學者專家之意見，自來水加氟在牙齒形成期間能使牙齒之牙釉質含氟，較不易為酸溶解而能達到預防兒童齲齒之目的；但亦有學者指出，加氟可能對人體健康造成不良影響，而持反對立場。自來水水質攸關民眾健康至鉅，至今長期攝入氟對人體健康影響仍未有定論，是否加氟，除應由衛生主管機關作政策性決定外，並編列相關公共衛生保健經費，以支應本項非屬淨水處理必須藥品之費用。